가족회사의 운영체제는 교수, 학생, 기업간의 긴밀한 연계 시스템으로 운영, 유지되며 세가지 속성 모두 동반자적 관계의 협력체계를 가지고 있으며 아래는 그에 대한 설명이다.

교수는 학생에게 연구보조지원을 받고 기업에게 겸임교수연구비, 현장정보를 제공받아 산학실적우대 기술료수입을 얻는다. 이를 통해 학생에게는 산학기반 맞춤교육을 제공하며 기업에게는 기술개발, 기술이전, 장비지원을 제공한다.
학생은 교수에게 산학기반맞춤교육을 받고 기업에게 산학장학습, 현장교수, 실습공간을 제공받아 현장을 미리 체험해 볼 수 있는 현장실습학습 기회를 얻는다. 이를 통해 학생은 교수가 연구에 몰두 할 수 있도록 연구보조를 지원하며 기업에는 현장실습을 통하여 인력을 제공한다.
기업은 교수에게 기술개발, 기술이전, 장비지원을 받고 학생에게 현장 인력을 제공받아 기술혁신을 이뤄내고 대학장비를 활용하여 더 나은 성장체계를 갖는다. 이를 통해 기업은 교수에게 겸임교수 연구비 및 현장정보를 제공하고 학생에게는 산학장학습 및 현장교수, 실습공간을 제공한다.